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C57BL/6J小鼠
根据目前基因组数据,Lep 基因存在2 个转录产物,见下图:
http://asia.ensembl.org/Mus_musculus/Gene/Summary?db=core;g=ENSMUSG00000059201;r=6:29060220-29073877
Lep 保守区域分析:
根据Lep 基因组结构和蛋白功能保守区,Lep 有2 个转录产物。选取Lep-201进行设计,Exon2-3(aa1-167),为编码蛋白的转录产物的外显子,而且也是Lep 基因所有转录本Lep-202 的全部的外显子序列,删除这Exon2-3 后,翻译该蛋白的mRNA 将不会被转录出来,而且该基因被完全敲除。因此决定在Exon2-3 的两边设计靶点,实现Exon2-3 敲除。
下面将根据Exon8 设计条件性敲除方案。
转录产物Lep-201 的基因组结构:
基因敲除构建设计。
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