为了分析结核分枝杆菌感染树鼩肺组织中蛋白质表达变化,分别取高、低剂量组感染的树鼩肺组织和正常对照组的肺组织,利用蛋白裂解液裂解后,通过iTRAQ定量质谱方法分析差异蛋白,在相对定量时,如果同一个蛋白质的量在两个样品间没有显著的变化,那么其蛋白质丰度比接近于1。当蛋白的丰度比即差异倍数达到1.5倍以上或小于0.67倍,且经统计检验其P-value值小于0.05时,视该蛋白为不同样品间的差异蛋白。高剂量组(TH-A)与低剂量组(TH-B)相比筛选到的上调蛋白和下调蛋白分别为144和76个;高剂量组(TH-A)与正常对照组(TH-C)相比筛选到的上调蛋白和下调蛋白分别为134和53个;低剂量组(TH-B)与正常对照组(TH-C)相比筛选到的上调蛋白和下调蛋白分别为9和20个。高剂量组的部分表达上调的差异蛋白可能与结核感染相关,而在人类中,这些蛋白已证实与结核感染密切相关,如表3.1所示。将差异蛋白在KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库中进行比对,以人类相关蛋白为对照,差异蛋白参与的信号通路如下:肌动蛋白细胞骨架、吞噬、钙离子信号通路、Jak-STAT信号通路、抗原加工及呈递、CD45/MAPK信号通路、自噬通路,这些信号通路都与结核分枝杆菌感染相关,如图3.3所示。然而,一些已证实与结核感染有关的固有免疫相关的信号通路并未在感染结核的树鼩模型中发现,如:Toll-like受体信号通路、NOD-like受体信号通路和Mincle/Dectin-1/DC-SIGN介导的NF-κB信号通路。